中心按照“小核心、大网络”的架构建设，与粤港澳、国内大企业、大学、科研院校建立了密切的科技合作关系，形成“产、学、研”结合的企业技术创新网络。先后共建5个联合实验室，2个研究所，7个分中心。

（一）联合实验室

1、2003年与香港中文大学组建“NERC-CUHK中药标准化和研发联合实验室”；

2、2002年与香港城市大学组建“NERC-CityU中草药研发联合实验室”；

3、2005年与澳门大学组建“NERC-UM联合实验室”；

4、2003年与中山大学组建“NERC-SLS SYSU联合实验室”；

5、2003年与暨南大学组建“NERC-JNU联合实验室”；

（二）研究所

1、韶关利民注射剂研究所，承担国家级研究开发项目2项，省部级研究开发项目12项。其中已验收和完成的项目有7项，正在实施项目有7项；

2、四川光大固体制剂研究所，承担省级研究开发项目1项，市级研究开发项目6项。其中已验收和完成的项目有4项，正在实施项目有3项；

（三）分中心

1、2001年、2013年与广州中医药大学、东莞广州中医药大学中医药数理工程研究院合作成立广州分中心、东莞分中心；

2、2008年与中国科学院昆明植物研究所合作在玉溪市维和生物技术有限公司成立西南资源分中心；

3、2011年与国家中医药管理局药用芳香油重点研究室在广东同德药业有限公司成立湛江药用植物油分中心；

4、2013年与中山火炬职业技术学院合作成立中山健康产品分中心；

5、2013年与暨南大学合作成立岭南特色中药分中心；

6、2014年与香港浸会大学中医药学院联合共建香港分中心，开展组合药物研究、适配子结合的中药新药研发、西方草药资源研究工作；